El estudio sobre la secuenciación del genoma de Mycobacterium sp. Panama NTM2, un aislado recuperado de un paciente con tuberculosis en Panamá, fue liderado por comunidad científica del INDICASAT AIP, Minsa y universidades panameñas, en colaboración internacional
Por: Violeta Villar Liste
Una investigación colaborativa internacional liderada por Panamá permite presentar a la comunidad científica global la secuencia genómica completa de la cepa Panama NTM2 de Mycobacterium sp., aislada de una muestra de esputo de un paciente con tuberculosis pulmonar en Panamá.
El estudio, que se publica en la revista Microbiology Resource Announcements, de la Sociedad Americana de Microbiología, concluye que Panama NTM2 representa una nueva especie dentro del género Mycobacterium, con lo cual el país “contribuye al inventario global de biodiversidad bacteriana”, explican a LWS la Dra. Joanna E. Rivas Ramos, autora principal por la Universidad Latina de Panamá y la Universidad Interamericana de Panamá (UIP), junto con el Dr. Amador Goodridge, por el Instituto de Investigaciones Científicas y Servicios de Alta Tecnología de Panamá (INDICASAT-AIP), en calidad de autor correspondiente.
- Fermín Acosta, Luis C. Mejía, Priya Patel, Johanna Elizabeth Ku, Indira J. Quintero y Dilcia Sambrano participan en la investigación por el Instituto de Investigaciones Científicas y Servicios de Alta Tecnología de Panamá (INDICASAT-AIP), situado en Ciudad del Saber. El Dr. Acosta y el Dr. Mejía también están adscritos al Sistema Nacional de Investigación (SNI-AIP), Panamá.
- Julio Jurado, Lizbeth Garibaldi y Mariela Delgado por la Caja de Seguro Social de Colón, Panamá.
- Odemaris Luque, por el Programa de Control de Tuberculosis, Ministerio de Salud, Colón, Panamá.
- Paul R. Johnston, por la Facultad de Medicina, Universidad de St Andrews, St Andrews, Escocia, Reino Unido.
Las micobacterias no son patógenas, pero sí causan infecciones
La investigación documenta que las micobacterias no tuberculosas (MNT) “son un grupo diverso de bacilos grampositivos, con forma de bastón y ácido-resistentes, estrechamente relacionados con importantes patógenos humanos obligados, como Mycobacterium tuberculosis”.
Por lo general no son patógenas, “sin embargo, pueden causar infecciones oportunistas en poblaciones inmunocomprometidas”.
En este estudio, presentan el genoma completo de Mycobacterium sp. Panama NTM2, aislado justamente de un paciente en la provincia de Colón (Colón) quien presentaba tuberculosis pulmonar.
En la investigación que proporciona una base para futuros análisis genómicos funcionales y comparativos, se utilizaron los métodos de la Guía Práctica Estándar para Microbiología Clínica.
La Secretaría Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (Senacyt) contribuyó con la financiación y la colaboración internacional facilitó la incorporación a plataformas de datos de acceso público.
Panama NTM2, una especie nueva
La Dra. Joanna E. Rivas Ramos explica que la secuenciación completa del genoma de Mycobacterium sp. Panama NTM2 es relevante “porque permite identificar con precisión absoluta un patógeno que, de otro modo, podría ser confundido con otro organismo”.
“Al obtener el genoma completo, hemos descubierto que Panama NTM2 es una especie nueva (con solo un 88.13% de Average Nucleotide Identity (ANI) respecto a su pariente más cercano). Esto es crítico porque las micobacterias no tuberculosas (MNT) a menudo presentan resistencias naturales a los antibióticos tradicionales para la tuberculosis y entender su genoma es el primer paso para no fallar en el tratamiento del paciente”.
-¿Cuáles son los hallazgos relevantes de esta secuenciación y cómo esta información nos puede ayudar en el diagnóstico y prevención de la enfermedad?
Destaca que los hallazgos principales incluyen, entre otros aspectos, la identificación de una especie nueva: Se determinó que es un organismo genéticamente único con un genoma de 5.92 Mbp y cuatro plásmidos.
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La secuencia permite identificar genes de resistencia antes de que el tratamiento falle en el paciente.
Además, «esta información permite diseñar pruebas moleculares más específicas que diferencien entre TB clásica y estas nuevas especies de MNT, evitando diagnósticos erróneos y asegurando que el paciente reciba el fármaco correcto desde el primer día».
Enfoque en una micobacteria no tuberculosa (MNT)
La investigadora precisa que a nivel mundial, existen bases de datos con miles de genomas de M. tuberculosis (como el linaje 4, muy común en América). En el caso de Panamá, ya se han realizado esfuerzos previos para secuenciar cepas locales de TB.
“Sin embargo, lo extraordinario de este estudio es que se enfoca en una micobacteria no tuberculosa (MNT) aislada de un contexto clínico, un área mucho menos explorada, pero de creciente importancia en la salud pública”, subraya.
Un testimonio del avance científico de Panamá
La Dra.Rivas Ramos reflexiona que este logro “es testimonio del avance científico de Panamá”.
Esta fortaleza descansa en varios pilares. Por un lado, una infraestructura de vanguardia a la cual logra acceder el país, articulado en enfuerzo internacional con compañías especializadas en la secuenciación de genomas bacterianos.
El talento humano especializado es otra fortaleza: se expresa en “a capacidad técnica para realizar el análisis bioinformático complejo (ensamblaje híbrido, anotación y filogenómica) de forma local”.
La colaboración Interinstitucional, con el apoyo de entidades como Senacyt y la red de salud pública que facilita la recuperación de aislados clínicos para investigación avanzada, es otro aspecto relevante.
Hacia el fin de la TB
-¿Cómo estos hallazgos contribuyen a la lucha global por poner fin a la TB en el mundo?
-La estrategia fin de la TB de la Organización Mundial de la Salud (OMS) no solo requiere tratar la TB, sino también entender todo el espectro de enfermedades micobacterianas.
Al respecto, Panama NTM2 aporta a la lucha global al “cerrar brechas de vigilancia”, porque al identificar patógenos emergentes que «imitan» a la TB, es posible ayuda a reducir la incidencia de tratamientos inadecuados.
En el ámbito de la comunidad científica internacional, “al publicar este genoma, Panamá contribuye al inventario global de biodiversidad bacteriana, permitiendo que científicos de todo el mundo desarrollen mejores vacunas y fármacos que sean efectivos contra una gama más amplia de micobacterias”, un logro en la lucha por más equidad en salud.
Referencia científica: Rivas Ramos JE, Acosta F, Patel P, Ku JE, Quintero IJ, Sambrano D, Jurado J, Garibaldi L, Delgado M, Luque O, de Waard JH, Mejía LC, Johnston PR, Goodridge A.0.Complete genome sequence data for Mycobacterium sp. Panama NTM2, an isolate recovered from a tuberculosis patient in Panama. Microbiol Resour Announc0:e00026-26.https://doi.org/10.1128/mra.00026-26
